Gıda mühendisliği yüksek lisans programı kimya mühendisliği, çevre ve ziraat mühendisliği gibi yakın mühendislik branşları ve biyoteknoloji ve biyomühendislik, malzeme mühendisliği gibi disiplinler arası branşlardan gelen öğrenciler için yüksek eğitim imkanı sunmaktadır. Mezun öğrenciler gıda kimyası, gıda mikrobiyolojisi ve gıda mühendisliği ve prosesi ile ilgili derinlemesine eğitim alırlar.